Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT12Q99456 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT12Q99456 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT12Q99456 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT12Q99456 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms