Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MMS19Q96T76 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MMS19Q96T76 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMS19Q96T76 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms