Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMNAT3Q96T66 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMNAT3Q96T66 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 302.6 ms