Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY1Q96T51 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY1Q96T51 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY1Q96T51 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms