Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABS1Q96KC9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABS1Q96KC9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms