Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERAC1Q96JX3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERAC1Q96JX3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERAC1Q96JX3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERAC1Q96JX3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms