Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC45A3Q96JT2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC45A3Q96JT2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.2 ms