Protein–RNA interactions for Protein: Q96JL9

ZNF333, Zinc finger protein 333, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF333Q96JL9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF333Q96JL9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF333Q96JL9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF333Q96JL9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF333Q96JL9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF333Q96JL9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF333Q96JL9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF333Q96JL9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF333Q96JL9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF333Q96JL9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF333Q96JL9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF333Q96JL9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF333Q96JL9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF333Q96JL9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms