Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMP6Q96FZ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP6Q96FZ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 346.1 ms