Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGF29Q96ES7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SGF29Q96ES7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGF29Q96ES7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms