Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf44Q96CB5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf44Q96CB5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms