Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C17orf50Q8WW18 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C17orf50Q8WW18 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf50Q8WW18 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms