Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC7Q8WUI4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC7Q8WUI4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms