Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC9Q8TBE3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC9Q8TBE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms