Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
AVL9Q8NBF6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AVL9Q8NBF6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.8 ms