Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAE3

LINC01555, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01555, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01555Q8NAE3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01555Q8NAE3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC01555Q8NAE3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01555Q8NAE3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms