Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNA2D3Q8IZS8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA2D3Q8IZS8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA2D3Q8IZS8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.8 ms