Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHERPQ8IWX8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHERPQ8IWX8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHERPQ8IWX8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms