Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PALB2Q86YC2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALB2Q86YC2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALB2Q86YC2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PALB2Q86YC2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.7 ms