Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPCAT2Q7L5N7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT2Q7L5N7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms