Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00299Q6ZSB3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00299Q6ZSB3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00299Q6ZSB3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms