Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BROXQ5VW32 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BROXQ5VW32 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BROXQ5VW32 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BROXQ5VW32 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms