Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF17Q5VTA0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms