Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XKR3Q5GH77 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.57■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.54■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.52■■■□□ 2
XKR3Q5GH77 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
XKR3Q5GH77 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XKR3Q5GH77 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms