Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFTN2Q52LD8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFTN2Q52LD8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms