Protein–RNA interactions for Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRK1Q38SD2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRK1Q38SD2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRK1Q38SD2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms