Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST2H2ACQ16777 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST2H2ACQ16777 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST2H2ACQ16777 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST2H2ACQ16777 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST2H2ACQ16777 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST2H2ACQ16777 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST2H2ACQ16777 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST2H2ACQ16777 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST2H2ACQ16777 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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