Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1EQ15878 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1EQ15878 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA1EQ15878 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA1EQ15878 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.6 ms