Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED1Q13445 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMED1Q13445 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMED1Q13445 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
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