Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA3FQ13275 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA3FQ13275 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA3FQ13275 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms