Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CGNL1Q0VF96 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CGNL1Q0VF96 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CGNL1Q0VF96 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CGNL1Q0VF96 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms