Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPIRE1Q08AE8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPIRE1Q08AE8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPIRE1Q08AE8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms