Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RBL2Q08999 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBL2Q08999 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBL2Q08999 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBL2Q08999 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBL2Q08999 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBL2Q08999 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBL2Q08999 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBL2Q08999 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBL2Q08999 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBL2Q08999 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBL2Q08999 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms