Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 SUR7YML052W 909 nt5.65□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 ERG24YNL280C 1317 nt5.65□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 YLL066CYLL066C 3618 nt5.65□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 GPH1YPR160W 2709 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 ATG22YCL038C 1587 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 MPA43YNL249C 1629 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 LIP5YOR196C 1245 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 YOR268CYOR268C 399 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 OPI11YPR044C 354 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 MLS1YNL117W 1665 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 VHT1YGR065C 1782 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 PIL1YGR086C 1020 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 CBK1YNL161W 2271 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 CDC3YLR314C 1563 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 NUP57YGR119C 1626 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 DOC1YGL240W 753 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 YUR1YJL139C 1287 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 KTR5YNL029C 1569 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 GSH1YJL101C 2037 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 NAS6YGR232W 687 nt5.61□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 MCH2YKL221W 1422 nt5.61□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 CSC1YLR241W 2349 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 RPL2BYIL018W 765 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 YIL077CYIL077C 963 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 YAL045CYAL045C 309 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 CCW12YLR110C 402 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 HSP12YFL014W 330 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 YJL213WYJL213W 996 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 ATP23YNR020C 813 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 ARC35YNR035C 1029 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG39Q06159 HXT17YNR072W 1695 nt5.59□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 MHP1YJL042W 4197 nt5.59□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 YEL020CYEL020C 1683 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 RBS1YDL189W 1374 nt5.57□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 PIH1YHR034C 1035 nt5.57□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 PAM17YKR065C 594 nt5.57□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 LDB19YOR322C 2457 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 GEF1YJR040W 2340 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 YML122CYML122C 381 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 TAH11YJR046W 1815 nt5.55□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 RGD1YBR260C 2001 nt5.55□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 HOG1YLR113W 1308 nt5.55□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 RSA4YCR072C 1548 nt5.55□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 YML079WYML079W 606 nt5.55□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 EXG2YDR261C 1689 nt5.55□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.54□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 PET117YER058W 324 nt5.54□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 PRE5YMR314W 705 nt5.54□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 CIT2YCR005C 1383 nt5.54□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 SDH8YBR269C 417 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 MFG1YDL233W 1377 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG39Q06159 YMR074CYMR074C 438 nt5.52□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 PTH2YBL057C 627 nt5.52□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 SUN4YNL066W 1263 nt5.52□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 CDC7YDL017W 1524 nt5.52□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 RDR1YOR380W 1641 nt5.52□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 RMD9YGL107C 1941 nt5.51□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 YPQ2YDR352W 954 nt5.51□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 MTR3YGR158C 753 nt5.51□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 SKN1YGR143W 2316 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 PUP2YGR253C 783 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 OPI8YKR035C 642 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 YPL067CYPL067C 597 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 UME1YPL139C 1383 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 NFS1YCL017C 1494 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 SAC6YDR129C 1929 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 QNS1YHR074W 2145 nt5.5□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 TUB1YML085C 1344 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 DML1YMR211W 1428 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 CCT3YJL014W 1605 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 TRR2YHR106W 1029 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 PRS4YBL068W 981 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 YPQ1YOL092W 927 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 RPL43AYPR043W 279 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 SNT309YPR101W 528 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 DPM1YPR183W 804 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 PAT1YCR077C 2391 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 YPR204WYPR204W 3099 nt5.49□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 PCS60YBR222C 1632 nt5.48□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 BZZ1YHR114W 1902 nt5.48□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.48□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 RTC4YNL254C 1206 nt5.48□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 PHO85YPL031C 918 nt5.48□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 SUB2YDL084W 1341 nt5.48□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 PGI1YBR196C 1665 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 FZF1YGL254W 900 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 ERG27YLR100W 1044 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 RPR1RPR1 369 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 CST26YBR042C 1194 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 YPR127WYPR127W 1038 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 PAB1YER165W 1734 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 YFR006WYFR006W 1608 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 MPE1YKL059C 1326 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 YDR387CYDR387C 1668 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG39Q06159 TDP1YBR223C 1635 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 CYS3YAL012W 1185 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 MBF1YOR298C-A 456 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 AMN1YBR158W 1650 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 HDA1YNL021W 2121 nt5.45□□□□□ -1.54
ATG39Q06159 LSG1YGL099W 1923 nt5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.7 ms