Protein–RNA interactions for Protein: Q05948

YLR225C, Uncharacterized SVF1-like protein YLR225C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR225CQ05948 YDR215CYDR215C 414 nt7.75□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 PET117YER058W 324 nt7.75□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 DSE3YOR264W 1293 nt7.75□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 YIL092WYIL092W 1902 nt7.74□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 CDA1YLR307W 906 nt7.74□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 ERV25YML012W 636 nt7.74□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 MIX17YMR002W 471 nt7.74□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 MRPL24YMR193W 777 nt7.74□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 PCL10YGL134W 1302 nt7.74□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 BRN1YBL097W 2265 nt7.73□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 NBA1YOL070C 1506 nt7.73□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 KTR4YBR199W 1395 nt7.73□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 PEX3YDR329C 1326 nt7.73□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 ELP3YPL086C 1674 nt7.73□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 SVF1YDR346C 1446 nt7.72□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 PET10YKR046C 852 nt7.72□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 YNL234WYNL234W 1281 nt7.72□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 CDC16YKL022C 2523 nt7.71□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 REV7YIL139C 738 nt7.71□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt7.71□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 URE2YNL229C 1065 nt7.71□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 YNR048WYNR048W 1182 nt7.71□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 TRP1YDR007W 675 nt7.7□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 HIS1YER055C 894 nt7.7□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 ERG8YMR220W 1356 nt7.7□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 DPB2YPR175W 2070 nt7.69□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 FET5YFL041W 1869 nt7.69□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 YDR401WYDR401W 564 nt7.69□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 PET20YPL159C 762 nt7.69□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 NUP49YGL172W 1419 nt7.69□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 OM45YIL136W 1182 nt7.68□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 MAM3YOL060C 2121 nt7.67□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 FRA1YLL029W 2250 nt7.67□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 ADE2YOR128C 1716 nt7.67□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 YDR187CYDR187C 519 nt7.67□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 YMR295CYMR295C 594 nt7.67□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 YOL099CYOL099C 492 nt7.67□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 UIP4YPL186C 915 nt7.67□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 YBR113WYBR113W 483 nt7.67□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 TAE1YBR261C 699 nt7.67□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 LYS12YIL094C 1116 nt7.66□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.66□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 CAR2YLR438W 1275 nt7.66□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 RPS28AYOR167C 204 nt7.66□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 YNL040WYNL040W 1371 nt7.66□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 RAD59YDL059C 717 nt7.65□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt7.65□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 HXT11YOL156W 1704 nt7.65□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 YOR072WYOR072W 315 nt7.65□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 BEM1YBR200W 1656 nt7.65□□□□□ -1.18
YLR225CQ05948 ERR1YOR393W 1314 nt7.64□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 ERR2YPL281C 1314 nt7.64□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 MPC1YGL080W 393 nt7.64□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 ERP5YHR110W 639 nt7.64□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 NTG2YOL043C 1143 nt7.64□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 YOL079WYOL079W 399 nt7.64□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 CTR1YPR124W 1221 nt7.64□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 ADH5YBR145W 1056 nt7.64□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 ARO10YDR380W 1908 nt7.63□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 MSP1YGR028W 1089 nt7.63□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 YHC3YJL059W 1227 nt7.63□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 TIF2YJL138C 1188 nt7.63□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 TIF1YKR059W 1188 nt7.63□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 TSR2YLR435W 618 nt7.63□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 ZWF1YNL241C 1518 nt7.62□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 TOP3YLR234W 1971 nt7.62□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 VMA3YEL027W 483 nt7.62□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 SHO1YER118C 1104 nt7.62□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 YLL056CYLL056C 897 nt7.62□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 YBR226CYBR226C 411 nt7.62□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 BUD9YGR041W 1644 nt7.61□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 SEN34YAR008W 828 nt7.61□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 YBR027CYBR027C 333 nt7.61□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 SRM1YGL097W 1449 nt7.61□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 MRPL10YNL284C 969 nt7.6□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 ENP1YBR247C 1452 nt7.6□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 DMC1YER179W 1005 nt7.59□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 CUP2YGL166W 678 nt7.59□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 DIT1YDR403W 1611 nt7.59□□□□□ -1.19
YLR225CQ05948 YBR138CYBR138C 1575 nt7.59□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.58□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 RAI1YGL246C 1164 nt7.58□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 LSM12YHR121W 564 nt7.58□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 PEX12YMR026C 1200 nt7.58□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 MRPL36YBR122C 534 nt7.58□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 TPO1YLL028W 1761 nt7.58□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 LYS21YDL131W 1323 nt7.57□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 MHT1YLL062C 975 nt7.57□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 ZRT2YLR130C 1269 nt7.57□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 VPS65YLR322W 315 nt7.57□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 YNL017CYNL017C 339 nt7.57□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 SNN1YNL086W 309 nt7.57□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 YLL058WYLL058W 1728 nt7.57□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 ICP55YER078C 1536 nt7.57□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 ERG24YNL280C 1317 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 MSC3YLR219W 2187 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.6 ms