Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDR2Q01850 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDR2Q01850 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDR2Q01850 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms