Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP11AP98196 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP11AP98196 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11AP98196 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11AP98196 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11AP98196 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP11AP98196 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP11AP98196 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP11AP98196 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP11AP98196 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP11AP98196 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11AP98196 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11AP98196 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP11AP98196 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP11AP98196 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11AP98196 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP11AP98196 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms