Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELNP78509 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RELNP78509 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELNP78509 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELNP78509 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELNP78509 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELNP78509 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELNP78509 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELNP78509 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELNP78509 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RELNP78509 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RELNP78509 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RELNP78509 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RELNP78509 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RELNP78509 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RELNP78509 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RELNP78509 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELNP78509 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RELNP78509 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELNP78509 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELNP78509 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELNP78509 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELNP78509 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELNP78509 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RELNP78509 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RELNP78509 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RELNP78509 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RELNP78509 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RELNP78509 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RELNP78509 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RELNP78509 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RELNP78509 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RELNP78509 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELNP78509 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RELNP78509 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RELNP78509 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RELNP78509 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RELNP78509 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RELNP78509 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RELNP78509 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RELNP78509 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RELNP78509 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RELNP78509 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RELNP78509 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RELNP78509 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RELNP78509 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RELNP78509 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RELNP78509 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RELNP78509 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RELNP78509 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RELNP78509 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RELNP78509 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RELNP78509 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RELNP78509 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RELNP78509 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELNP78509 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELNP78509 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELNP78509 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELNP78509 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELNP78509 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELNP78509 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELNP78509 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELNP78509 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELNP78509 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELNP78509 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELNP78509 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELNP78509 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RELNP78509 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RELNP78509 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RELNP78509 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RELNP78509 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RELNP78509 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RELNP78509 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELNP78509 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELNP78509 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELNP78509 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RELNP78509 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RELNP78509 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RELNP78509 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RELNP78509 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RELNP78509 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RELNP78509 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELNP78509 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELNP78509 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELNP78509 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RELNP78509 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELNP78509 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELNP78509 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELNP78509 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELNP78509 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELNP78509 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELNP78509 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELNP78509 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELNP78509 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELNP78509 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RELNP78509 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELNP78509 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELNP78509 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELNP78509 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELNP78509 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms