Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23AP54725 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD23AP54725 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms