Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLNS1AP54105 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLNS1AP54105 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLNS1AP54105 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194 ms