Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2AP49459 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2AP49459 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2AP49459 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms