Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK1P39086 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK1P39086 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK1P39086 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms