Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPA3P35244 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPA3P35244 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPA3P35244 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA3P35244 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA3P35244 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA3P35244 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA3P35244 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA3P35244 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA3P35244 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA3P35244 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA3P35244 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA3P35244 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA3P35244 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA3P35244 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA3P35244 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA3P35244 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPA3P35244 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPA3P35244 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPA3P35244 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPA3P35244 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPA3P35244 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPA3P35244 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPA3P35244 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA3P35244 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA3P35244 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA3P35244 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA3P35244 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA3P35244 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA3P35244 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA3P35244 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPA3P35244 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPA3P35244 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPA3P35244 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPA3P35244 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPA3P35244 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPA3P35244 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPA3P35244 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA3P35244 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA3P35244 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA3P35244 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPA3P35244 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA3P35244 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA3P35244 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA3P35244 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA3P35244 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA3P35244 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPA3P35244 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPA3P35244 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPA3P35244 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPA3P35244 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPA3P35244 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPA3P35244 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPA3P35244 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPA3P35244 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPA3P35244 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA3P35244 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA3P35244 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPA3P35244 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA3P35244 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA3P35244 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA3P35244 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA3P35244 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA3P35244 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPA3P35244 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA3P35244 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA3P35244 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA3P35244 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA3P35244 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPA3P35244 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA3P35244 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA3P35244 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPA3P35244 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA3P35244 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA3P35244 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA3P35244 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPA3P35244 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA3P35244 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA3P35244 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA3P35244 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPA3P35244 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA3P35244 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA3P35244 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPA3P35244 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPA3P35244 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPA3P35244 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA3P35244 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA3P35244 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA3P35244 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA3P35244 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA3P35244 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA3P35244 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA3P35244 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA3P35244 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPA3P35244 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA3P35244 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA3P35244 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA3P35244 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA3P35244 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPA3P35244 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms