Protein–RNA interactions for Protein: P28324

ELK4, ETS domain-containing protein Elk-4, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK4P28324 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELK4P28324 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELK4P28324 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELK4P28324 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ELK4P28324 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELK4P28324 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELK4P28324 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELK4P28324 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELK4P28324 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELK4P28324 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELK4P28324 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELK4P28324 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ELK4P28324 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELK4P28324 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ELK4P28324 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELK4P28324 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELK4P28324 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELK4P28324 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELK4P28324 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELK4P28324 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELK4P28324 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELK4P28324 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELK4P28324 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELK4P28324 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELK4P28324 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELK4P28324 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELK4P28324 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELK4P28324 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELK4P28324 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELK4P28324 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELK4P28324 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELK4P28324 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ELK4P28324 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELK4P28324 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELK4P28324 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELK4P28324 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELK4P28324 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELK4P28324 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELK4P28324 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELK4P28324 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELK4P28324 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELK4P28324 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELK4P28324 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELK4P28324 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELK4P28324 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELK4P28324 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELK4P28324 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ELK4P28324 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELK4P28324 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELK4P28324 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELK4P28324 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELK4P28324 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELK4P28324 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELK4P28324 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELK4P28324 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELK4P28324 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELK4P28324 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELK4P28324 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELK4P28324 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELK4P28324 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELK4P28324 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELK4P28324 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELK4P28324 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELK4P28324 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELK4P28324 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELK4P28324 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELK4P28324 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELK4P28324 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELK4P28324 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELK4P28324 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELK4P28324 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELK4P28324 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELK4P28324 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELK4P28324 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELK4P28324 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELK4P28324 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELK4P28324 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELK4P28324 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELK4P28324 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELK4P28324 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELK4P28324 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELK4P28324 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms