Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX1P27695 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX1P27695 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX1P27695 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APEX1P27695 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX1P27695 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX1P27695 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX1P27695 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX1P27695 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX1P27695 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX1P27695 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX1P27695 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX1P27695 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX1P27695 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX1P27695 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX1P27695 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX1P27695 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX1P27695 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX1P27695 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX1P27695 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX1P27695 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX1P27695 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX1P27695 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX1P27695 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX1P27695 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX1P27695 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX1P27695 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX1P27695 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX1P27695 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX1P27695 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX1P27695 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX1P27695 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX1P27695 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX1P27695 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX1P27695 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX1P27695 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX1P27695 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX1P27695 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX1P27695 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX1P27695 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX1P27695 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX1P27695 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX1P27695 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX1P27695 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APEX1P27695 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APEX1P27695 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX1P27695 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX1P27695 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX1P27695 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX1P27695 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX1P27695 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX1P27695 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX1P27695 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX1P27695 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX1P27695 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX1P27695 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX1P27695 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX1P27695 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX1P27695 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX1P27695 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX1P27695 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX1P27695 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX1P27695 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX1P27695 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX1P27695 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX1P27695 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX1P27695 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX1P27695 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX1P27695 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX1P27695 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX1P27695 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX1P27695 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX1P27695 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX1P27695 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX1P27695 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX1P27695 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX1P27695 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX1P27695 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APEX1P27695 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX1P27695 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX1P27695 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX1P27695 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX1P27695 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APEX1P27695 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX1P27695 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX1P27695 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX1P27695 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX1P27695 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX1P27695 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX1P27695 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX1P27695 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX1P27695 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APEX1P27695 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX1P27695 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX1P27695 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX1P27695 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX1P27695 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX1P27695 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APEX1P27695 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APEX1P27695 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms