Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APCP25054 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APCP25054 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APCP25054 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APCP25054 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APCP25054 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APCP25054 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APCP25054 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APCP25054 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APCP25054 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APCP25054 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APCP25054 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APCP25054 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APCP25054 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCP25054 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCP25054 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCP25054 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCP25054 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCP25054 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCP25054 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCP25054 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCP25054 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCP25054 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCP25054 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCP25054 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APCP25054 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APCP25054 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCP25054 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCP25054 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCP25054 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCP25054 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCP25054 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCP25054 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCP25054 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APCP25054 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APCP25054 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APCP25054 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APCP25054 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APCP25054 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APCP25054 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APCP25054 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APCP25054 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APCP25054 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APCP25054 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APCP25054 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCP25054 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCP25054 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCP25054 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCP25054 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCP25054 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APCP25054 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCP25054 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCP25054 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCP25054 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCP25054 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCP25054 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCP25054 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCP25054 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCP25054 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCP25054 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APCP25054 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APCP25054 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APCP25054 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APCP25054 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APCP25054 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APCP25054 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
APCP25054 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.33■■□□□ 1
APCP25054 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.33■■□□□ 1
APCP25054 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APCP25054 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APCP25054 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APCP25054 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APCP25054 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APCP25054 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
APCP25054 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APCP25054 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APCP25054 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APCP25054 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APCP25054 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APCP25054 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APCP25054 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
APCP25054 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APCP25054 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
APCP25054 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APCP25054 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APCP25054 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APCP25054 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APCP25054 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APCP25054 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APCP25054 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APCP25054 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APCP25054 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
APCP25054 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APCP25054 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APCP25054 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APCP25054 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
APCP25054 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APCP25054 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APCP25054 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APCP25054 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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