Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGFR4P22455 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGFR4P22455 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms