Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR1P18146 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR1P18146 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EGR1P18146 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR1P18146 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR1P18146 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR1P18146 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR1P18146 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR1P18146 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR1P18146 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR1P18146 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR1P18146 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR1P18146 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EGR1P18146 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR1P18146 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR1P18146 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR1P18146 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR1P18146 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EGR1P18146 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR1P18146 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR1P18146 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR1P18146 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR1P18146 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR1P18146 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR1P18146 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR1P18146 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR1P18146 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR1P18146 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR1P18146 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EGR1P18146 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EGR1P18146 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EGR1P18146 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EGR1P18146 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EGR1P18146 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR1P18146 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR1P18146 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR1P18146 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR1P18146 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR1P18146 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EGR1P18146 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR1P18146 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR1P18146 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR1P18146 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EGR1P18146 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR1P18146 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR1P18146 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR1P18146 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR1P18146 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR1P18146 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR1P18146 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR1P18146 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR1P18146 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR1P18146 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR1P18146 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR1P18146 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR1P18146 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EGR1P18146 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR1P18146 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR1P18146 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR1P18146 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR1P18146 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR1P18146 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR1P18146 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EGR1P18146 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR1P18146 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EGR1P18146 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR1P18146 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR1P18146 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR1P18146 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR1P18146 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EGR1P18146 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR1P18146 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR1P18146 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EGR1P18146 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EGR1P18146 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EGR1P18146 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR1P18146 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR1P18146 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR1P18146 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR1P18146 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR1P18146 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR1P18146 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR1P18146 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EGR1P18146 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR1P18146 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR1P18146 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR1P18146 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EGR1P18146 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR1P18146 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR1P18146 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR1P18146 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR1P18146 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR1P18146 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR1P18146 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR1P18146 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR1P18146 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR1P18146 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR1P18146 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR1P18146 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR1P18146 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms