Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCK1P16333 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCK1P16333 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCK1P16333 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCK1P16333 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCK1P16333 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCK1P16333 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCK1P16333 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCK1P16333 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCK1P16333 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCK1P16333 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCK1P16333 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCK1P16333 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCK1P16333 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCK1P16333 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCK1P16333 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCK1P16333 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCK1P16333 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCK1P16333 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCK1P16333 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCK1P16333 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCK1P16333 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCK1P16333 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NCK1P16333 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCK1P16333 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NCK1P16333 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCK1P16333 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCK1P16333 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCK1P16333 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCK1P16333 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCK1P16333 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCK1P16333 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCK1P16333 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCK1P16333 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCK1P16333 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCK1P16333 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCK1P16333 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCK1P16333 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCK1P16333 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCK1P16333 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCK1P16333 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCK1P16333 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCK1P16333 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCK1P16333 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCK1P16333 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCK1P16333 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCK1P16333 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCK1P16333 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCK1P16333 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCK1P16333 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCK1P16333 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCK1P16333 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCK1P16333 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCK1P16333 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NCK1P16333 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCK1P16333 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCK1P16333 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCK1P16333 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCK1P16333 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NCK1P16333 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCK1P16333 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCK1P16333 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCK1P16333 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCK1P16333 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCK1P16333 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCK1P16333 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCK1P16333 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCK1P16333 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCK1P16333 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCK1P16333 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCK1P16333 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCK1P16333 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCK1P16333 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCK1P16333 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NCK1P16333 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCK1P16333 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NCK1P16333 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCK1P16333 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCK1P16333 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCK1P16333 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCK1P16333 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCK1P16333 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCK1P16333 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCK1P16333 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCK1P16333 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCK1P16333 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCK1P16333 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCK1P16333 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCK1P16333 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCK1P16333 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCK1P16333 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCK1P16333 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCK1P16333 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCK1P16333 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCK1P16333 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCK1P16333 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCK1P16333 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCK1P16333 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCK1P16333 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCK1P16333 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms