Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ITGB4P16144 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ITGB4P16144 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ITGB4P16144 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ITGB4P16144 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms